ゼクスシリーズ第1弾。前作に引き続きダブルプレイヤーシステムがあるが差が激しくなっている。 ボスから入手できるものは、Aトランスコアというもので、それが発動すると主人公の肉体をそれを所持していたボスに変形させる。等身まで変わってしまい、基本アクションが変わってしまうために場所によっては有利になったり不利になったりする。とはいえ、前作と違い属性だけでなく攻撃技・移動技・ボスの体までも入手できるという斬新なシステムである。なお、Aトランスコアによる変身システムはロックマンX7からきている。 また、等身を変えずに形態・属性だけを変化させる前作のライブメタルシステムも(データコピーによるトランスオンという形で)登場する。今作はフォルスロイドに加え、ライブメタルを持つ新たな4人の適合者が存在する。 Aトランスコアを持つフォルスロイドと、ライブメタルを守る4人のロックマンがボス。個性的な能力と独特の操作が求められるAトランスコアと、軽快なアクションで突き進めるライブメタルを使い分けてゲームを進めていく。